广州健康院于2003年7月由中国科学院、广东省人民政府、广州市人民政府三方签约共建，于2006年3月获得中编办批复正式成立。是中国科学院首个面向地方经济社会的发展需求、在实施“知识创新工程”试点中与地方共建的研究所，填补了当时华南地区生物医药领域国立科研机构的空白，对中国新型研发机构实有筚路蓝缕的探索之功。 广州健康院面向人民健康，聚焦生命健康领域前沿重大科学问题和重要疾病机理，以建成国际一流的生物医药与健康领域新型研发机构和创新人才培养高地为目标，提供保障人类健康和疾病防控的原创性基础理论、突破性前沿技术与系统性解决方案为使命，优化科技成果快速转化的机制与途径，满足国家战略需求和区域经济社会发展，促进生物医药产业发展，发挥国家战略科技力量的核心作用。 当前，广州健康院以人类细胞谱系大科学研究设施建设为契机，瞄准“细胞谱系解析与干预”这一前沿科技主攻方向，分别从谱系科学、谱系技术、谱系数据、谱系应用等四个方面进行战略布局，建有细胞谱系研究中心、谱系技术与装备研究中心、数字生物医学研究中心、发育与再生医学研究中心、医药创新研究所等5个科研单元；建有完善的所级科研条件综合支撑中心，拥有分析测试中心、实验动物中心、生物医学数据与超算中心、治疗性细胞制备研究中心、移动式生物安全三级实验室，以及多个特色支撑平台等完善的支撑体系。在此基础上，已建成广东省干细胞与再生医学重点实验室、广东省生物医药计算重点实验室、中国—新西兰生物医药与健康“一带一路”联合实验室、呼吸疾病全国重点实验室（与广州医科大学共建）、中国科学院免疫应答与免疫治疗重点实验室（与中国科学技术大学共建）等多个国家级、省部级实验室平台。 广州健康院国际交流与合作密切。在新西兰开展了CAR-T细胞治疗淋巴瘤的I期临床试验，成为新西兰首个引进的CAR-T技术以及首个获批CAR-T临床试验；与莫里斯·威尔金斯研究中心联合研发的靶向抗肿瘤新药LX-132胶囊获一类新药临床批件；与德国马普学会、新西兰奥克兰大学、香港大学、香港中文大学等建立了多项合作关系。广州健康院迄今已举办了13届广州国际干细胞与再生医学论坛，吸引了包括诺贝尔奖获得者等学者到会作报告。 与中国科学技术大学、广州医科大学等国内多所高校开展“共建系”“共建学院”等教育合作，与新西兰奥克兰大学、香港中文大学等境外知名高校联合培养博士研究生。研究生导师是从海内外引进的优秀科学家，大多数曾在世界一流的大学、科研机构担任教授、副教授，或在跨国制药公司担任高级研发及管理人员，在科学研究、人才培养等方面有着较为丰富的经验。